育苗穴盘的穴孔形状主要有方形和圆形，方形穴孔所含基质一般要比圆形穴孔多30%左右，水分分布亦较均匀，种苗根系发育更加充分。
育苗穴盘的颜色会影响植物根部的温度。白色的聚苯泡沫盘反光性较好，多用于夏季和秋季提早育苗，以利反射光线，减少小苗根部热量积聚。而冬季和春季选择黑色育苗盘，因其吸光性好，对小苗根系发青有利。
使用穴盘苗的优点：
（1）节省种子用量，降低生产成本。
（2）出苗整齐，保持植物种苗生长的一致性。
（3）能与各种手动及自动播种机配套使用，便于集中管理，提高工作效率。
（4）移栽时不损伤根系，缓苗迅速，成活率高。
